『ソードアート・オンライン』（SAO）の世界設定をもとに作り上げられたスピンアウト小説『ソードアート・オンライン オルタナティブ ガンゲイル・オンライン』をコミカライズ！物語の舞台となるのは、『SAO』の《ファントム・バレット編》のなかで描かれたVR（ヴァーチャルリアリティ）ゲーム、《ガンゲイル・オンライン》。このゲームでは、戦争により荒廃した未来世界にダイブしたプレイヤーが、銃火器を武器にモンスターやほかのプレイヤーと戦っていく。主人公は、そんな殺伐としたゲームとは無縁の生活を送っていた女子大生・小比類巻香蓮。長身がコンプレックスの彼女は、《ガンゲイル・オンライン》でかわいくて小柄なアバター（ゲーム中のキャラクター）を手に入れたことから、もう1人の自分「レン」として、ゲームの世界での生活を楽しむようになる。そして、いつしかチーム対抗のバトルロイヤル戦《スクワット・ジャム》に参加することになり……!?